Qual é a diferença entre usar Object.create () e usar o operador de atribuição?

Aqui estão alguns exemplos.

// case 1:
var obj1 = {msg : 'Hello'};
var obj2 = obj1;
obj2.msg = "Hi!"; //overwrites
alert(obj1.msg); //=>'Hi!'

// case 2:
var obj1 = {msg : 'Hello'};
var obj2 = Object.create(obj1);
obj2.msg = "Hi!"; //does not overwrite
alert(obj1.msg); //=>'Hello'

// case 3:
var obj1 = {data: { msg : 'Hello'}}
var obj2 = Object.create(obj1);
obj2.data.msg = "Hi!"; //overwrites, Why?
alert(obj1.data.msg); //=>'Hi!'

eu acho queObject.create() apenas dá ambos os pontos apontam para o mesmo protótipo, enquanto a atribuição faz o objeto apontar para o mesmo local (não apenas protótipo).Mas então por que o objeto de dados está sendo sobrescrito no caso 3?