Percorrendo todos os arquivos no diretório R, aplicando vários comandos [duplicado]
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Qual é o melhor método para aplicar um script repetidamente em n arquivos .csv em R? 2 respostasPreciso aplicar um conjunto de comandos em R a todos os indivíduos.txtrquivos (cerca de 300) em um diretóri
Eu não estou muito familiarizado com R, então toda a ajuda que eu vi on-line sobre loop é confusa ou não consigo descobrir como aplicar um loop quando você precisar aplicar vários comandos a cada arquiv
Os comandos que preciso aplicar a cada arquivo (árvores filogenéticas) dentro do diretório são (que usa a biblioteca de macacos de R):
testtree <- read.tree("tree123.txt")
unrooted_tr <- unroot(testtree)
write.tree(unrooted_tr, file="unrootedtree123.txt")
Como aplico um loop que aplicará esses comandos a cada arquivo .txt individual (usando R ou na linha de comando do Unix)? A saída (por exemplo, unrootedtree123.txt) precisará ter um nome diferente para cada arquivo individual.
Agradecemos antecipadamente, Dani.