Venn diagrama de la lista de grupos y factores concurrentes

Tengo un archivo de entrada con una lista de ~ 50000 grupos y la presencia de varios factores en cada uno de ellos (~ 10 millones de entradas en total), vea un ejemplo más pequeño a continuación: set.seed(1) x = ...

cómo cambiar el factor de género en una codificación numérica en r