He creado un ejemplo de una cuadrícula deslizante con encabezados fijos, utilizando las tecnologías "Diseño de cuadrícula CSS" y "posición fija". Para mayor comodidad, el contenido de la cuadrícula es generado por un script, que creo que funciona bien.

function fillGrid(selector, rows) {
  let cols = 3;
  let grid = $(selector);
  
  grid.empty();
  
  //cr header
  grid.append($('<div>').addClass('hcr').text('#'));
  
  //col headers
  for (let c = 1; c <= cols; c++) {
    grid.append($('<div>').addClass('hc').text(`Column ${c}`));
  }
  
  for (let r = 1; r <= rows; r++) {
    //row header
    grid.append($('<div>').addClass('hr').text(r));
    
    //cells
    for (let c = 1; c <= cols; c++) {
      grid.append($('<div>').addClass('c').text(`Cell ${r}-${c}`));
    }
  }
}

$('#reload').click(e => {
  var rows = Number.parseInt($('#rows').val());
  fillGrid('#grid1', rows);
})

$(document).ready(function() {
  fillGrid('#grid1', 10);
});

body {
  font-family: 'Segoe UI', sans-serif;
  font-size: 12px;
}

.grid {
  display: grid;
  width: 600px;
  height: 300px;
  grid-template-columns: 40px 200px 100px 500px;
  grid-auto-rows: min-content;
  border: 1px solid #ccc;
  overflow: scroll;
  margin-top: 20px;
  background-color: #aaa;
  margin-right: 10px;
}

.hcr, .hc, .hr {
  background-color: #ddd;
  border-right: 1px solid #ccc;
  border-bottom: 1px solid #ccc;
  padding: 2px;
  position: sticky;
}

.hcr {
  top: 0;
  left: 0;
  z-index: 1;
  text-align: center;
}

.hc {
  top: 0;
  white-space: nowrap;
}

.hr {
  left: 0;
  text-align: center;
}

.c {
  padding: 2px;
  border-right: 1px solid #ccc;
  border-bottom: 1px solid #ccc;
  background-color: #fff;
}

<script src="https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/2.1.1/jquery.min.js"></script>
<div>
  <input type="text" id="rows" value="10" />
  <input type="button" id="reload" value="Reload" />
</div>
<div class="grid" id="grid1"></div>

Hasta 999 filas, la cuadrícula funciona perfectamente. Cuando se cargan más de 999 filas, solo se muestran las celdas hasta la fila 999, mientras que las siguientes celdas se colocan incorrectamente a la izquierda sobre el encabezado de la fila 999.

El mismo ejemplo funciona correctamente en Firefox 56 y Edge 16 (versión 16299).

Donde me equivoco