alinear puntos y barras de error en ggplot cuando se usa `jitterdodge`

Question

Jun 16, 2017, 08:37 PM

alinear puntos y barras de error en ggplot cuando se usa `jitterdodge`

Los datos reproducibles a continuación contienen 50 observaciones para cada animal (gato y perro) para cada estación (verano e invierno) para dos covariables (cov1 y cov2) y sus respectivas estimaciones de error (SE).

library(ggplot2); library(dplyr); library(tidyr)
set.seed(123)
dat <- data.frame(Season = rep(c("Summer", "Winter"), each = 100),
                  Species = rep(c("Dog", "Cat", "Dog", "Cat"), each = 50),
                  cov1 = sample(1:100, 200, replace = TRUE),
                  cov1SE = rnorm(200),
                  cov2 = sample(1:100, 200, replace = TRUE),
                  cov2SE = rnorm(200))

head(dat)
  Season Species cov1      cov1SE cov2      cov2SE
1 Summer     Dog   29 -0.71040656   24 -0.07355602
2 Summer     Dog   79  0.25688371   69 -1.16865142
3 Summer     Dog   41 -0.24669188   23 -0.63474826
4 Summer     Dog   89 -0.34754260   32 -0.02884155
5 Summer     Dog   95 -0.95161857   18  0.67069597
6 Summer     Dog    5 -0.04502772   81 -1.65054654

A continuación, recopilo los datos en formato largo para ggplot

EstLong <- dat %>% gather(Cov, Estimate, c(cov1, cov2))
SE <- dat %>% gather(Cov, SE, c(cov1SE, cov2SE))
datLong <- EstLong[ , c(1,2,5,6)]
datLong$SE <- SE[ , 6]

head(datLong)
  Season Species  Cov Estimate          SE
1 Summer     Dog cov1       29 -0.71040656
2 Summer     Dog cov1       79  0.25688371
3 Summer     Dog cov1       41 -0.24669188
4 Summer     Dog cov1       89 -0.34754260
5 Summer     Dog cov1       95 -0.95161857
6 Summer     Dog cov1        5 -0.04502772

Estoy tratando de trazar todos los puntos y estoy usandoposition_jitterdodge para esquivar y fluctuar los puntos (como se sugiere enesta publicación SO), pero no puede alinear correctamente las barras de error con los puntos respectivos como se muestra a continuación.position_dodge alinea correctamente los puntos y las barras de error, perojitter es necesario para reducir la superposición a lo largo del eje x. Cualquier sugerencia sería muy apreciada.

Jit <- position_jitterdodge(dodge.width=0.4)

ggplot(datLong, aes(y = Estimate, x = Cov, color = Species)) +
  geom_point(position = Jit, size = 1) +
  geom_errorbar(aes(ymin = Estimate-SE, ymax = Estimate+SE), width = 0.2, position = Jit) +
  theme_bw() +
  facet_wrap(~ Season, ncol = 1, scales = "free") +
  scale_color_manual(values = c("blue", "red"))

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