Migraciones de Entity Framework: habilite las migraciones automáticas junto con la migración agregada

Estoy utilizando Entity Framework 4.3 Migrations en mi proyecto. Me gustaría usar las migraciones automáticas para que cuando realice modificaciones en mis objetos de dominio y mi clase de contexto, mi base de datos se actualice automáticamente cuando ejecuto el proyecto. Tengo esto trabajando hasta ahora.

También me gustaría usar algunas Migraciones agregadas además de las migraciones automáticas, y me gustaría que la aplicación salte automáticamente a la última versión (basada en mis migraciones agregadas) cuando ejecuto la aplicación.

Para hacer esto, he colocado esto en el archivo global.asax ...

Database.SetInitializer(new MigrateDatabaseToLatestVersion<MyContext, Core.Migrations.Configuration>());

Ahora esto funciona, pero cuando lo hago ya no se actualiza automáticamente la base de datos en función de los objetos de mi dominio.

Me gustaría poder eliminar completamente la base de datos y luego ejecutar la aplicación y hacer que se ejecuten todas las migraciones automáticas y luego ejecutar mis migraciones explícitas y llevar la base de datos a la última versión.

Sé que he tenido esto trabajando en un proyecto anterior, pero no estoy seguro de qué estoy haciendo mal en este caso.

Gracias

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