Bootstrap 3.3.6 JQuery 2.2.4 Excepción de versión

Estoy tratando de usar Bootstrap y JQuery en mi nueva aplicación ASP.Net Core. Pero me encuentro con el error "JavaScript de Bootstrap requiere jQuery versión 1.9.1 o superior, pero inferior a la versión 3" cuando intento ejecutar la aplicación.

He usado Bower para agregar Bootstrap a mi aplicación, y he agregado la versión 3.3.6 de Bootstrap que agrega automáticamente JQuery 2.2.4. El problema es que parece que la versión 2.2.4 de JQuery en realidad está versionada en 3.0.0-rc1, lo que hace que la validación de Bootstrap falle, ya que solo aceptará versiones de JQuery de la versión 1.9.1 pero menor que la versión 3.

¿Cómo puedo resolver este conflicto? ¿Cómo es que Bootstrap viene empaquetado con una versión incompatible de JQuery?

Aquí puede ver mis archivos en mi solución, mostrando las versiones Bootstrap y JQuery: como puede ver, tampoco hay otras versiones de JQuery instaladas.

Aquí hay un fragmento de mi marcado Html

<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head>
    <title></title>
    <link rel="stylesheet" href="~/lib/bootstrap/dist/css/bootstrap.min.css" />
</head>
<body>
    <h1>HELLOOOO!</h1>
    <script type="text/javascript" src="~/lib/jquery/dist/jquery.min.js"></script>
    <script type="text/javascript" src="~/lib/bootstrap/dist/js/bootstrap.min.js"></script>
</body>

</html>

Lo que resulta en informes de Chrome "JavaScript de Bootstrap requiere jQuery versión 1.9.1 o superior, pero inferior a la versión 3"

Cualquier ayuda sería muy apreciada!

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