Eclipse c ++ Type no pudo resolverse error a pesar de que la compilación es exitosa

He mezclado proyecto C ++ / Java en Eclipse. He configurado un archivo build.mk y el proyecto de compilación de Eclipse correctamente cuando todos los archivos en el editor están cerrados. Cuando abro un archivo .h o .cpp, Eclipse encuentra en ellos muchos símbolos indefinidos. Tengo referencias a la API de terceros y todos los problemas parecen estar relacionados con los símbolos de esa API. Extrañamente, algunos tipos se consideran definidos en Eclipse, y algunos se consideran indefinidos aunque en algunos casos se definen en el mismo archivo .h.

Mi colega no está experimentando ninguno de estos problemas, pero no sabemos por dónde empezar a resolver este problema. Ya nos aseguramos de que nuestros directorios de inclusión de Eclipse sean los mismos. ¿Hay alguna manera de comparar la configuración del proyecto eclipse?

Actualización: los archivos .cproject y los archivos .project y los archivos en el directorio .settings saben que solo se diferencian por algunas rutas. Aunque no ayudó a resolver mi problema.

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