¿Hay algún programa IDE o no que pueda formatear el código MySQL dentro de la cadena PHP, por ejemplo? Yo uso PHPStorm IDE y no puedo hacerlo.

Lo hace para PHP y MYSQL pero no para MYSQL dentro de la cadena php. Estoy listo para usar el nuevo IDE porque ahora tengo que formatear manualmente cientos de solicitudes de base de datos que son una línea y no son legibles. El único criterio para mi elección es que ide puede hacerlo automáticamente.

<?php
...
$request1 = "select * from tbl_admin where admin_id= {$_SESSION['admin_id']} and active= 1 order By admin_id Asc";
...
?>

debe convertirse

<?php
...
$request1 = "SELECT * 
               FROM tbl_admin 
                  WHERE admin_id = {$_SESSION['admin_id']}
                  AND active = 1
                      ORDER BY admin_id ASC";
...
?>