He estado intentando usar mongo con algunos datos importados, pero no puedo usarlo correctamente con la descripción de mi documento.

Este es un ejemplo de .json que importo usando mongoimport:https://gist.github.com/2917854

mongoimport -d test -c example data.json

Noté que todo mi documento se importó a un objeto único a pesar de crear uno de objeto para cada tienda.

Es por eso que cuando trato de encontrar una tienda o cualquier cosa que quiera consultar, se devuelve todo el documento.

db.example.find({"shops.name":"x"})

Quiero poder consultar la base de datos para obtener productos por el ID utilizando la notación de puntos algo similar a:

db.example.find({"shops.name":"x","categories.type":"shirts","clothes.id":"1"}

El problema es que todo el documento se importa como un solo objeto. La pregunta es: cómo
¿Necesito importar el objeto para obtener el resultado deseado?