Estoy trabajando en una aplicación HTML5 para iPad y ya he implementado un soporte tal para desencadenar eventos más rápido y estoy usando jQuery para apuntar a los elementos más fácilmente, pero para las animaciones estoy usando transiciones CSS3

¿Qué crees que es más rápido? ¿Utilizando animaciones de jQuery ya que ya he importado la biblioteca o uso transiciones CSS3 al seleccionar elementos con jQuery?