Unstaged ändert sich sofort nach dem Klonen in Eclipse

Ich verwende Atlassian Stash und das Git-Plugin für Eclipse Kepler und versuche, ein Repository zu klonen. Sobald ich es abgeschlossen habe, habe ich sofort N nicht bereitgestellte Änderungen, bei denen N bei jedem Versuch variieren. Wenn ich versuche, die beiden scheinbar unterschiedlichen Dateien zu vergleichen, gibt es keine einzige Änderung. Ich vermute, dass es einige Unterschiede zwischen den Metadaten der Dateien gibt, aber da ich nicht finde, was sich genau geändert hat, möchte ich die Dateien auch nicht festschreiben / pushen. Wie gesagt, die Anzahl der Dateien, die geändert wurden, ist völlig zufällig, und die Art der Dateien, die geändert wurden, ist ebenfalls ziemlich zufällig. (.project, .java, .groovy, + more).

Ich habe einen Blick auf @ hatdiese Frag, diese Frag, unddiese Frag aber keiner von ihnen hat meine Frage gelöst.

Irgendwelche Ideen, warum dies passiert?