У меня есть таблица данных с nrow около миллиона или два и ncol около 200.

Каждая запись в строке имеет координату, связанную с ней.

Крошечная часть данных:

[1,] -2.80331471  -0.8874522 -2.34401863   -3.811584   -2.1292443
[2,]  0.03177716   0.2588624  0.82877467    1.955099    0.6321881
[3,] -1.32954665  -0.5433407 -2.19211837   -2.342554   -2.2142461
[4,] -0.60771429  -0.9758734  0.01558774    1.651459   -0.8137684

Координаты для первых 4 строк:

9928202 9928251 9928288 9928319

То, что я хотел бы, это функция, которая, учитывая данные и размер окна, будет возвращать таблицу данных того же размера со средним скользящим окном, примененным к каждому столбцу. Или другими словами - для каждой записи строки я он найдет записи с координатами между координатами [i] -windsize и ords [i] + windsize и заменит начальное значение средним значением внутри этого интервала (отдельно для каждого столбца).

Скорость является главной проблемой здесь.

Вот мой первый дубль такой функции.

doSlidingWindow