Это все, что мне нужно. Дополнительные сведения: у меня есть папка src / bootstrap / java и обычная папка src / main / java. Каждому нужно идти в отдельную банку по понятным причинам. Я смог создать загрузочную банку с помощьюэто:

  <plugin>
    <artifactId>maven-jar-plugin</artifactId>
    <version>2.3.1</version>
    <executions>
      <execution>
        <id>only-bootstrap</id>
        <goals><goal>jar</goal></goals>
        <phase>package</phase>
        <configuration>
          <classifier>bootstrap</classifier>
          <includes>
            <include>sun/**/*</include>
          </includes>
        </configuration>
      </execution>
    </executions>
  </plugin>

Но обычный фляга все еще включает классы начальной загрузки. Я собираю классы начальной загрузки сэтот ответ.

Любой источник света для создания myproject.jar БЕЗ классов начальной загрузки?