у перенаправить печать в файл .txt с помощью Python. У меня есть цикл for, который будет «печатать» выходные данные для каждого из моих файлов .bam, в то время как я хочу перенаправить ВСЕ эти выходные данные в один файл. Вот я и попытался поставить

 f = open('output.txt','w'); sys.stdout = f

в начале моего сценария. Однако я ничего не получаю в файле .txt. Мой сценарий:

#!/usr/bin/python

import os,sys
import subprocess
import glob
from os import path

f = open('output.txt','w')
sys.stdout = f

path= '/home/xug/nearline/bamfiles'
bamfiles = glob.glob(path + '/*.bam')

for bamfile in bamfiles:
    filename = bamfile.split('/')[-1]
    print 'Filename:', filename
    samtoolsin = subprocess.Popen(["/share/bin/samtools/samtools","view",bamfile],
                                  stdout=subprocess.PIPE,bufsize=1)
    linelist= samtoolsin.stdout.readlines()
    print 'Readlines finished!'
    ........print....
    ........print....

Так в чем проблема? Любой другой способ, кроме этого sys.stdout?

Мне нужно, чтобы мой результат выглядел так:

Filename: ERR001268.bam
Readlines finished!
Mean: 233
SD: 10
Interval is: (213, 252)