Если вы используете axis2.war, log4j.properties есть в axis2.war / WEB-INF / classes, поэтому вы должны установить log4j.properties в classpath.
ss-6.0.0.Final, похоже, нет jboss-log4j.xml, который использовался для настройки параметров log4j в jboss5 (то есть в папке server / default / conf / jboss-log4j.xml)