Я столкнулся с этой проблемой, и не было четкого объяснения о том, как обойти эту ошибку.

Последняя версия R (v. 3.1.2) для OS X Mavericks зависает в Yosemite всякий раз, когда я пытаюсь сохранить файл, который написан с использованием внутреннего редактора R. Он также зависает при попыткеsource функция.

Редактировать: Предполагалось, что это будет вопрос с самостоятельным ответом, но я нашел лучший ответ, поэтому отметил его как ответ.