построение сообществ в iGraph
Я хотел бы воспроизвести вид диаграммы "Сводка сообщества", как на странице 6 этого документа:http://arxiv.org/pdf/0803.0476v2.pdf
Сначала на графике используется алгоритм сообщества, например:
wc <- walktrap.community(subgraph)
mc <- multilevel.community(subgraph)
Затем вершины группируются по сообществу. Размер узла сообщества является функцией размера членства, а ширина ребра является функцией общего ребра, идущего от любого члена сообщества А к сообществу Б.
пожалуйста, обратите вниманиеЯ не просто хочу кодировать сообщество как цвет или выпуклые оболочки нравится:
V(inSubGraph)$color <- commObj$membership+1
plot.igraph( inSubGraph, vertex.color = V(inSubGraph)$color)
или с выпуклыми корпусами:
plot(commObj, inSubGraph)