На этот вопрос уже есть ответ:

У меня почти получилось. Я хотел знать, был ли Много лучший способ

Корневая проблема

Fiddle

function replaceURLWithHTMLLinks(text) {
    text = text.replace(/a/g, "--ucsps--");
    text = text.replace(/b/g, "--uspds--");
    var arrRegex = [
        /(\([^)]*\b)((?:https?|ftp|file):\/\/[-A-Za-z0-9+&@#\/%?=~_()|!:,.;]*[-A-Za-z0-9+&@#\/%=~_()|])(\))/ig,
        /(\([^)]*\b)((?:https?|ftp|file):\/\/[-A-Za-z0-9+&@#\/%?=~_()|!:,.;]*[-A-Za-z0-9+&@#\/%=~_()|])(.?\b)/ig,
        /()(\b(?:https?|ftp|file):\/\/[-a-z0-9+&@#\/%?=~_()|!:,.;]*[-a-z0-9+&@#\/%=~_()|])(.?\b)/ig];
    for (i = 0; i < arrRegex.length; i++) {
        text = text.replace(arrRegex[i], "$1a$2b$3");
    }
    text = text.replace(/a([^b]*)b/g, "<a href='$1'>$1</a>");
    text = text.replace(/--ucsps--/g, "a");
    text = text.replace(/--uspds--/g, "b");
    return text;
}
var elm = document.getElementById('trythis');
elm.innerHTML = replaceURLWithHTMLLinks(elm.innerHTML);

Есть предположения